发布文件介绍

文件命名

文件的名称由三个部分组成，每个部分通过下划线“_”分开。文件名称命名如：汇知医学知识图谱_“资源名称”_“发布日期”，文件名称之后为文件扩展名。

资源名称

文件名的“资源名称”描述了该文件所包含的内容信息。若该名称相同但发布时间不同，则说明文件中所涉及内容范围相同，且最近时间的为最新版本。

发布日期

文件名的“发布日期”描述了该文件发布日期，用于对资源的版本控制，标准格式为“YYYYMMDD”。

文件格式

发布文件分为两种：

  • 文件包统一使用的压缩格式“.zip”；
  • 单个数据文件统一使用UTF-8编码的文本文件“.txt”。

实体标识符

每次发布时每个实体都有唯一的数字标识符表示，为19位的随机数值，不具备任何意义。

数据类型

  • Long integer：长整型，64位无符号整数；
  • String：字符型，指定长度的UTF-8文本；
  • Number ：数值型，以‘0’到‘9’数字形式表示相应的值。

字段命名规范

第一行为标题行，文件中每列的字段名称，字段名称使用“小骆驼拼写法”（如entityType）。


文件内容规范

数据表字段说明


表 1：数据表字段说明

字段名

字段含义

数据类型

说明

relationId关系IDLonginteger用于表示每条三元组的唯一标识符，19位的数值

entityId

实体ID

Longinteger

用于表示同一实体的标识符，19位的数值

entity实体String用于表示该实体的名称

entityType

实体语义类型

String

表示实体对应的OMAHA Schema中语义类型的名称

property

属性名称

String

OMAHA Schema中属性关系的名称

valueId

值ID

Longinteger

用于表示值所对应实体的标识符，19位的数值

value

值

String

用于表示关系所对应的值

valueType

值语义类型

String

表示值对应的OAMAH Schema中语义类型的名称

group

关系组

Number

非零整数，相同时则关系为一组；若为0，则不成组

source来源String表示本条三元组的来源


  • 关系ID：标识本条三元组的唯一ID，三元组不变则ID不变，可在版本更新时作为比对字段。
  • 实体与实体ID：标识本条三元组中的主语，并且为所有实体的唯一ID。
  • 实体语义类型：标识本条三元组中作为主语实体的语义类型，具体对应OMAHA Schema中语义类型。
  • 属性名称：标识本条三元组中的属性，具体对应OMAHA Schema中属性关系的名称。
  • 值与值ID：标识本条三元组中的属性值。若本条三元组中的属性为数据属性时，值为具体的数据内容，值ID为空；若本条三元组中的属性为对象属性时，值为实体名，值ID为所对应的实体ID。
  • 值语义类型：标识本条三元组中的属性值的语义类型。若本条三元组中的属性为对象属性时，值语义类型代表作为属性值的实体具体对应OMAHA Schema中属性关系的名称；若本条三元组中的属性为数据属性时，值语义类型则为空。
  • 关系组：标识本条三元组所在的关系组，是一个非负整数。当group为0时，则代表本条三元组与其他三元组均不成组，当group不为0时，则表示本条三元组与其他相同group的三元组成组存在。
  • 来源：表示本条三元组的来源和出处，可为空。

数据文件示例

数据文件示例如表2，每行表示一条关系，以三元组的方式，将实体与值通过指定的属性关系进行连接。

表2：知识图谱数据文件示例

relationIdentityIdentityentityTagpropertyvalueIdvaluevalueTaggroupsource
16678947088774076891567677492256854752氯达香豆素药品用药目的1567676794582572635治疗用药用药目的1OMAHA数字医学知识专家
16678947118134359971567677492256854752氯达香豆素药品适应证1567677480308565885心绞痛疾病1OMAHA数字医学知识专家
16678947913585583001567677492256854752氯达香豆素药品用药目的1567676794582572635治疗用药用药目的2OMAHA数字医学知识专家
16678943174277122311567677492256854752氯达香豆素药品适应证1567677480303201803心衰疾病2OMAHA数字医学知识专家
16678948211874656191567677492256854752氯达香豆素药品适用人群1567676794560080675老年人人群3OMAHA数字医学知识专家
16678946645309257931567677492256854752氯达香豆素药品用药目的1567676794582572635治疗用药用药目的3OMAHA数字医学知识专家
16678947353757994971567677492256854752氯达香豆素药品适应证1567677479222158265冠心病疾病3OMAHA数字医学知识专家
16678977066323760481567677492256854752氯达香豆素药品七巧板医学术语集概念ID
11784193
0OMAHA“七巧板”医学术语集


***特殊属性解释***

*七巧板医学术语集概念ID

指该实体所对应的“OMAHA七巧板医学术语集”中的概念ID标识符。本条属性的建立是为了方便机构用户能够更好地将“汇知医学知识图谱”与“OMAHA七巧板医学术语集”结合起来应用。若实体无该属性，则代表该实体暂时无法映射到“OMAHA七巧板医学术语集”。

*等同于

为了方便企业更好地理解和使用“汇知”医学知识图谱，2022年2月，OMAHA对实体ID体系进行了更新，在新的实体ID体系中，每个实体名称+语义标签拥有唯一的实体ID，实体融合后用“等同于”关系来表示同义关系。

例如，在原来的实体ID体系中，“HIV感染”和“艾滋病”分别为实体ID“1567677480226606765”的名称和别称，表示二者的同义关系，三元组的组织方式如下：

entityIdentityentityTagpropertyvalueIdvaluevalueTaggroupsource
1567677480226606765HIV感染疾病名称
HIV感染
0
1567677480226606765HIV感染疾病别称
艾滋病
0


而在新的实体ID体系中“1567677480226606765”表示“HIV感染”，“1638862616359641908”表示“艾滋病”，二者的同义关系则简化表示为：

entityIdentityentityTagpropertyvalueIdvaluevalueTaggroupsource
1567677480226606765HIV感染疾病等同于1638862616359641908艾滋病疾病0
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