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2019年12月25日,OMAHA首次发布“临床路径”知识图谱,并持续维护更新。

为了更好地促进计算机对于知识体系的应用,我们以OMAHA七巧板医学术语集为基础,对知识图谱的实体的内容进行了标准化和概念化,助力系统实现语义层面的互操作。

本应用指南对实体、关系、构建方式、属性值、发布数据统计、数据资源下载等内容进行了解释说明,供使用者了解具体的构建思路,帮助更精准地应用该资源。


 关系表达模型


自卫生部2009年发布《卫生部关于开展临床路径管理试点工作的通知》(卫医政发〔2009〕116号)以来,卫健委共牵头发布了一千余篇临床路径,OMAHA通过收集研究目前市面上所有的临床路径,构建了临床路径的知识表达框架,主要包括:适用对象、相适用人群、治疗阶段、治疗方式、适用科室、就诊类型、标准治疗时长、治疗相关检查项目等,具体关系的解释说明见下表:

1“临床路径-疾病治疗相关检查关系表达模型

关系

定义

临床路径

发布日期

日期

指临床路径的公开发布的日期

临床路径

适用范围

文本

指临床路径所适用的范围

临床路径

适用对象

临床所见

指临床路径所适用的疾病和症状等

临床路径

适用人群

人群

指临床路径适用于具有一些相同特征的人群,如成人、儿童等

临床路径

治疗阶段

治疗阶段

指临床路径所适用的治疗阶段,如初治、复治和康复等

临床路径

治疗方式

操作

指临床路径所适用的治疗方法,如放疗、化疗、手术等

临床路径

科室

临床科室

指临床路径所适用的临床科室,如内科、外科等

临床路径

就诊类型

就诊类型

指临床路径所适用的就诊类型,包括门诊、住院等

临床路径

标准治疗时长

文本

指临床路径规定的标准住院时间或治疗疗程等

临床路径

治疗相关检查项目

操作

指临床路径所适用的疾病在住院或者门诊诊疗期间需要做的检查项目,包括必需检查项目和备选检查项目

临床路径

治疗必需检查项目

操作

指临床路径所适用的疾病在住院或者门诊诊疗期间必需要做的检查项目

临床路径

治疗备选检查项目

操作

指临床路径所适用的疾病在住院或者门诊诊疗期间根据情况来确定是否需要做的检查项目

临床路径

治疗前检查

操作

指临床路径所适用的疾病在相关治疗前或手术术前需要做的检查项目,包括治疗前必需检查和备选检查

临床路径

治疗前必需检查

操作

指临床路径所适用的疾病在相关治疗前或手术术前必需要做的检查项目

临床路径

治疗前备选检查

操作

指临床路径所适用的疾病在相关治疗前或手术术前根据情况来确定是否需要做的检查项目

临床路径

治疗后检查

操作

指临床路径所适用的疾病在相关治疗后或手术术后需要复查的检查项目,包括术后必需检查和备选检查

临床路径

治疗后必需检查

操作

指临床路径所适用的疾病在相关治疗后或手术术后必需要复查的检查项目

临床路径

治疗后备选检查

操作

指临床路径所适用的疾病在相关治疗后或手术术后根据情况来确定是否需要复查的检查项目

完整的OMAHA知识图谱schema详见:http://schema.omaha.org.cn/class/Thing

构建方式的说明


数据来源

所有数据均来源于卫健委自2009年以来牵头发布的一千余篇临床路径。

构建规则

通过自然语言处理与文本挖掘技术,采用机器与人工相结合的方式进行构建。

质量控制

  1.  实体都最大化与“七巧板”医学术语集建立映射,保证数据的标准化和深度应用;
  2.  最终所有数据都由专业人员进行了审核,确保内容的正确性。


属性值的说明


发布日期

指临床路径的公开发布的日期,如2009年、2016年等。

适用范围

指临床路径所适用的范围,根据卫健委发布的不同版本,一般可分为“县级医院版”和“通用版”,县级医院版的属性值中均有说明,未建该属性的临床路径为“通用版”。

适用对象

临床路径的“适用对象”的取值内容已最大化映射至“OMAHA七巧板医学术语集”中的“临床所见”领域的概念。其中,对于目前无法映射到“OMAHA七巧板医学术语集”的实体,我们都与“OMAHA七巧板医学术语集”中的相关概念建立层级关系(is-A),尽可能丰富地表达适应证的语义内涵。

适用人群

“适用人群”属性的属性值为OMAHA知识图谱中“人群”类,主要划分标准为年龄、性别和临床特征等。本次发布主要分为成人、儿童等。

治疗阶段

“治疗阶段”属性的属性值为OMAHA知识图谱中“限定词”中“治疗阶段”类,主要克分为初治、复治、康复等。

治疗方式

“治疗方式”属性的属性值也已最大化映射至“OMAHA七巧板医学术语集”中的“操作”等领域的概念,既包括“手术、放疗、化疗”等相对较顶层的概念、也包括具体的手术操作的名称、如“贲门癌根治术、肾穿刺活检”。其中,对于目前无法映射到“OMAHA七巧板医学术语集”的实体,我们同样都与“OMAHA七巧板医学术语集”中的相关概念建立层级关系(is-A)。

科室

“科室”属性的属性值为OMAHA知识图谱中“科室”类,主要包括内科、外科、儿科等。

就诊类型

“就诊类型”属性的属性值为OMAHA知识图谱中“限定词”中“就诊类型”类,主要分为门诊和住院。

标准治疗时长

“标准治疗时长”属性为数据属性,属性值为文本,来源于临床路径中规定的标准住院日和标准治疗疗程等。

治疗相关检查

“治疗相关检查”属性可分为必需检查和可选检查,必需检查为临床路径规定治疗期间必需进行的检查,可选检查为临床路径中说明根据患者病情来决定是否需要进行的检查;同时也分为治疗前检查和治疗后检查,治疗前检查即为相关的治疗(如手术或化疗等)前所做的检查,治疗后检查即为相关的治疗(如手术或化疗等)后所做的检查。属性值均为OMAHA知识图谱中“操作”类,同时也已最大化映射至“OMAHA七巧板医学术语集”中的“操作”等领域的概念,对于目前无法映射到“OMAHA七巧板医学术语集”的实体,我们同样都与“OMAHA七巧板医学术语集”中的相关概念建立层级关系(is-A)。

最新发布数据统计


实体统计

实体语义类型的详细统计如下表:

实体语义类型数量
观测操作3942
临床所见3778
疾病2664
操作2071
药物治疗方案1435
药品1408
临床路径1235
操作治疗方案833
医疗器械306
给药途径54
事件43
人群17
空间关系11
组织机构7
治疗阶段3
饮食类型3
就诊类型2
合计17812

关系统计

关系类型的详细统计如下表:

关系类型数量
名称17812
别称15124
住院/门诊期间必需检查10652
诊断依据9604
治疗前必需检查7534
OMAHA概念ID7323
住院/门诊期间备选检查4777
诊断相关检查4633
治疗方式3931
选择用药3831
变异及原因分析3710
出院标准2900
治疗前备选检查2376
治疗方案2269
治疗后必需检查1950
用法用量1758
适用对象1645
治疗药物1475
术后用药1267
就诊类型1235
发布日期1235
标准治疗时长1187
麻醉方式1066
术中用药1009
适应证1001
给药途径904
治疗后备选检查868
植介入器械660
手术日631
治疗后恢复时间576
治疗前准备时间481
手术输血情况468
治疗后复查448
与…鉴别诊断404
入院/门诊后必需复查348
住院/门诊期间相关检查309
使用的器械250
术前用药191
治疗前检查175
术中操作158
适用人群101
禁忌证85
适用范围80
入院/门诊后备选复查72
科室46
入院/门诊后复查42
用药相关检查41
治疗阶段34
预防性抗菌药物29
入路22
参考费用标准13
操作后饮食类型3
合计118743

映射统计

最新发布数据包包含与“OMAHA七巧板医学术语集”的映射关系,有映射实体的语义类型详细统计如下表:

映射语义类型数量
疾病2098
临床所见625
药品686
空间关系6
给药途径19
医疗器械96
操作1032
观测操作2754
组织机构7
合计7323


样例数据下载


为让大家对知识图谱有更直观的了解途径,现从发布内容中摘取了部分内容作为样例数据,欢迎下载!

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